Sebagai titik pengobatan kesehatan terbaik di provinsi Papua, RSUD Jayapura senantiasa meningkatkan mutu jasa kesehatan kepada masyarakat. Fasilitas modern dan sumber daya manusia medis profesional hadir untuk merespon berbagai kasus medis , dari rawat jalan hingga tindakan operasi. Upaya perbaikan konsisten juga diselenggarakan untuk memastikan ke